Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VAMP4O75379 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms