Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAK2O60296 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms