Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PLIN1O60240 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PLIN1O60240 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms