Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KCNQ2O43526 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNQ2O43526 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms