Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
FOXO3O43524 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXO3O43524 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms