Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MEFVO15553 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MEFVO15553 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms