Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VGFO15240 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VGFO15240 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VGFO15240 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VGFO15240 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VGFO15240 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VGFO15240 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VGFO15240 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
VGFO15240 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
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