Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KDM6BO15054 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
KDM6BO15054 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms