Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SETD1AO15047 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SETD1AO15047 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms