Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERVV-2B6SEH9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-2B6SEH9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms