Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CYSRT1A8MQ03 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms