Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ARID3CA6NKF2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ARID3CA6NKF2 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms