Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRAV26-1A0A087WT03 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRAV26-1A0A087WT03 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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