Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
FBXO3Q9UK99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
FBXO3Q9UK99 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
FBXO3Q9UK99 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
FBXO3Q9UK99 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
FBXO3Q9UK99 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
FBXO3Q9UK99 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
FBXO3Q9UK99 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
FBXO3Q9UK99 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms