Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nectin3Q9JLB9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nectin3Q9JLB9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nectin3Q9JLB9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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