Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PudpQ9D5U5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PudpQ9D5U5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PudpQ9D5U5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PudpQ9D5U5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PudpQ9D5U5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms