Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZS1

FOXP3, Forkhead box protein P3, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP3Q9BZS1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXP3Q9BZS1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FOXP3Q9BZS1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FOXP3Q9BZS1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FOXP3Q9BZS1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXP3Q9BZS1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms