Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RIOK1Q9BRS2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
RIOK1Q9BRS2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RIOK1Q9BRS2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.41
RIOK1Q9BRS2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RIOK1Q9BRS2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms