Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PHACTR3Q96KR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PHACTR3Q96KR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PHACTR3Q96KR7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PHACTR3Q96KR7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHACTR3Q96KR7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms