Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC71

SPATA18, Mitochondria-eating protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA18Q8TC71 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SPATA18Q8TC71 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
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SPATA18Q8TC71 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
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SPATA18Q8TC71 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPATA18Q8TC71 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA18Q8TC71 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPATA18Q8TC71 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SPATA18Q8TC71 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
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