Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
KDM1BQ8NB78 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM1BQ8NB78 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KDM1BQ8NB78 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM1BQ8NB78 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms