Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM46Q7Z4K8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM46Q7Z4K8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRIM46Q7Z4K8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM46Q7Z4K8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRIM46Q7Z4K8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRIM46Q7Z4K8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms