Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 41.6
DHX30Q7L2E3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.454e-6■■■■■ 41.5
DHX30Q7L2E3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.94e-6■■■■■ 41.5
DHX30Q7L2E3 RNF166-205ENST00000562544 502 ntTSL 519.66■□□□□ 0.744e-6■■■■■ 41.5
DHX30Q7L2E3 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.371e-6■■■■■ 41.4
DHX30Q7L2E3 BAHCC1-206ENST00000584436 10801 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■■■■■ 41.4
DHX30Q7L2E3 CBFA2T3-207ENST00000564416 399 ntTSL 518.15■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 41
DHX30Q7L2E3 PLEC-209ENST00000526416 583 ntTSL 319.75■□□□□ 0.752e-6■■■■■ 40.9
DHX30Q7L2E3 PLEC-212ENST00000527816 583 ntTSL 315.71■□□□□ 0.112e-6■■■■■ 40.9
DHX30Q7L2E3 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 40.9
DHX30Q7L2E3 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 40.9
DHX30Q7L2E3 CTBP1-216ENST00000514669 809 ntTSL 319.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 40.7
DHX30Q7L2E3 CTBP1-207ENST00000505826 657 ntTSL 519.91■□□□□ 0.781e-6■■■■■ 40.7
DHX30Q7L2E3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 531.74■■■□□ 2.674e-7■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.354e-7■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 MACROD1-206ENST00000542359 459 ntTSL 318.53■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 40.6
DHX30Q7L2E3 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 40.3
DHX30Q7L2E3 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.533e-6■■■■■ 40.3
DHX30Q7L2E3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 40.3
DHX30Q7L2E3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.412e-6■■■■■ 40.3
DHX30Q7L2E3 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 320.82■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 40.2
DHX30Q7L2E3 SLC19A1-205ENST00000443742 777 ntTSL 318.46■□□□□ 0.551e-6■■■■■ 40.2
DHX30Q7L2E3 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.537e-8■■■■■ 40.1
DHX30Q7L2E3 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC6.52□□□□□ -1.375e-9■■■■■ 40
DHX30Q7L2E3 PKP4-208ENST00000462335 561 ntTSL 411.03□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 39.9
DHX30Q7L2E3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 01e-6■■■■■ 39.9
DHX30Q7L2E3 SEPT5-215ENST00000490204 774 ntTSL 523.99■■□□□ 1.433e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.173e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 SEPT5-203ENST00000406172 1996 ntTSL 527.35■■□□□ 1.972e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 518.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 518.08■□□□□ 0.482e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FZR1-207ENST00000591290 1331 ntTSL 523.03■■□□□ 1.283e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FZR1-208ENST00000592214 598 ntTSL 319.16■□□□□ 0.663e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.533e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.363e-6■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 39.8
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-203ENST00000525083 1228 ntTSL 220.39■□□□□ 0.854e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-207ENST00000527004 1760 ntTSL 517.35■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-204ENST00000525770 1427 ntTSL 217.34■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.364e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.34e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-217ENST00000534011 1955 ntTSL 214.84□□□□□ -0.034e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-218ENST00000534315 2210 ntTSL 1 (best)14.66□□□□□ -0.064e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-210ENST00000530642 3045 ntTSL 211.3□□□□□ -0.64e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 FOXRED1-216ENST00000533839 559 ntTSL 411.29□□□□□ -0.64e-12■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.642e-6■■■■■ 39.7
DHX30Q7L2E3 CTBP1-205ENST00000504092 920 ntTSL 522.31■■□□□ 1.161e-6■■■■■ 39.5
DHX30Q7L2E3 BBC3-205ENST00000598636 900 ntTSL 227.93■■■□□ 2.061e-7■■■■■ 39.4
DHX30Q7L2E3 ADARB1-212ENST00000496664 5033 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 ADARB1-203ENST00000389861 5031 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 ADARB1-211ENST00000492414 4913 ntTSL 1 (best)21.1■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.41e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.033e-7■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 39.3
DHX30Q7L2E3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.793e-6■■■■■ 39.1
DHX30Q7L2E3 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.23e-6■■■■■ 39.1
DHX30Q7L2E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.765e-6■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 MACROD1-208ENST00000545464 899 ntTSL 329.2■■■□□ 2.265e-6■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.822e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 CIC-208ENST00000575839 335 ntTSL 518.71■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.442e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.272e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 SGTA-204ENST00000589251 637 ntTSL 316.02■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 312.17□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC10.79□□□□□ -0.682e-9■■■■■ 39
DHX30Q7L2E3 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC9.66□□□□□ -0.861e-12■■■■■ 38.8
DHX30Q7L2E3 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-6■■■■■ 38.6
DHX30Q7L2E3 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.673e-6■■■■■ 38.6
DHX30Q7L2E3 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)9.96□□□□□ -0.823e-6■■■■■ 38.6
DHX30Q7L2E3 EXD3-205ENST00000475006 1132 ntTSL 324.84■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.573e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 EXD3-202ENST00000460390 1432 ntTSL 222.05■■□□□ 1.123e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 CD81-217ENST00000533417 444 ntTSL 320.73■□□□□ 0.912e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 38.5
DHX30Q7L2E3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.823e-6■■■■■ 38.4
DHX30Q7L2E3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.522e-6■■■■■ 38.4
DHX30Q7L2E3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 38.4
DHX30Q7L2E3 AKT1-215ENST00000555926 553 ntTSL 323.14■■□□□ 1.292e-6■■■■■ 38.4
DHX30Q7L2E3 MTND6P4-201ENST00000506002 522 ntBASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 38.3
DHX30Q7L2E3 ZC3H3-202ENST00000528401 546 ntTSL 321.09■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 38.1
DHX30Q7L2E3 ZC3H3-201ENST00000262577 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 38.1
Retrieved 100 of 5,617 protein–RNA pairs in 34.1 ms