Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
VSTM1Q6UX27 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
VSTM1Q6UX27 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSTM1Q6UX27 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSTM1Q6UX27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms