Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTR9Q6PD62 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CTR9Q6PD62 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CTR9Q6PD62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CTR9Q6PD62 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CTR9Q6PD62 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms