Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm3558Q5FWC9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm3558Q5FWC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm3558Q5FWC9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm3558Q5FWC9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm3558Q5FWC9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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