Protein–RNA interactions for Protein: Q15424

SAFB, Scaffold attachment factor B1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAFBQ15424 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.782e-8■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.89□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.182e-8■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 RNF220-207ENST00000470498 594 ntTSL 35.2□□□□□ -1.582e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.042e-9■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.62e-9■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.062e-9■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.542e-9■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 23.88□□□□□ -1.792e-9■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-203ENST00000527184 486 ntTSL 317.44■□□□□ 0.382e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-210ENST00000532624 985 ntTSL 1 (best)16.43■□□□□ 0.222e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-204ENST00000528161 1067 ntTSL 1 (best)14.36□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-214ENST00000533921 122 ntTSL 314.24□□□□□ -0.132e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-201ENST00000278200 795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.332e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-211ENST00000532668 735 ntTSL 312.95□□□□□ -0.342e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-205ENST00000529749 475 ntTSL 312.73□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-206ENST00000530023 552 ntTSL 312.32□□□□□ -0.442e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-209ENST00000532287 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.632e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 IMMP1L-208ENST00000531693 437 ntTSL 27.75□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 11.5
SAFBQ15424 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 11e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 320.36■□□□□ 0.851e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.781e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.761e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.691e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 418.39■□□□□ 0.531e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 215.13■□□□□ 0.011e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 Z97192.3-201ENST00000420902 2975 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.111e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)12.81□□□□□ -0.361e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 KDM4B-207ENST00000588961 560 ntTSL 410□□□□□ -0.811e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 AC010615.2-201ENST00000596705 566 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.778e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.558e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-217ENST00000510984 505 ntTSL 317.93■□□□□ 0.468e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-212ENST00000508045 1112 ntTSL 1 (best)16.77■□□□□ 0.288e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-206ENST00000504563 840 ntTSL 516.1■□□□□ 0.178e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-214ENST00000508482 1597 ntTSL 214.86□□□□□ -0.038e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-213ENST00000508218 533 ntTSL 214.42□□□□□ -0.18e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-207ENST00000505619 658 ntTSL 314.07□□□□□ -0.168e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-215ENST00000509335 582 ntTSL 213.91□□□□□ -0.188e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-208ENST00000505658 7040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.528e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-221ENST00000513025 594 ntTSL 35.4□□□□□ -1.548e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 LUC7L3-210ENST00000507200 510 ntTSL 44.77□□□□□ -1.658e-7■■□□□ 11.4
SAFBQ15424 AP005263.1-202ENST00000578850 198 ntTSL 221.72■■□□□ 1.076e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 ANKRD12-205ENST00000546007 978 ntTSL 54.31□□□□□ -1.726e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.22e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 ZNF581-202ENST00000585995 591 ntTSL 321.56■■□□□ 1.042e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 ZNF580-204ENST00000590190 335 ntTSL 321.54■■□□□ 1.042e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 CCDC106-208ENST00000592996 741 ntTSL 320.45■□□□□ 0.862e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 GABRE-202ENST00000417300 619 ntTSL 213.67□□□□□ -0.222e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 GABRE-203ENST00000441219 1324 ntTSL 29.51□□□□□ -0.892e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 GABRE-201ENST00000370328 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -12e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.032e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.261e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.641e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.69□□□□□ -1.661e-6■□□□□ 11.3
SAFBQ15424 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.332e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 DSCR4-201ENST00000328264 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.42e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 DSCR4-202ENST00000398948 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 424.01■■□□□ 1.433e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 523.58■■□□□ 1.373e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 422.41■■□□□ 1.183e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 321.09■□□□□ 0.973e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-221ENST00000473028 556 ntTSL 419.91■□□□□ 0.783e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-207ENST00000423862 581 ntTSL 319.7■□□□□ 0.743e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 319.11■□□□□ 0.653e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-208ENST00000424287 589 ntTSL 418.56■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-224ENST00000476767 590 ntTSL 418.56■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-219ENST00000457322 623 ntTSL 417.92■□□□□ 0.463e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-228ENST00000487550 587 ntTSL 317.22■□□□□ 0.353e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.233e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-211ENST00000433831 3267 ntTSL 516.38■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.023e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-230ENST00000492381 3619 ntTSL 212.39□□□□□ -0.433e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 MED15-209ENST00000428629 572 ntTSL 410.43□□□□□ -0.743e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ASH1L-201ENST00000368346 11942 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.524e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.94e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.391e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.944e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ZZZ3-210ENST00000476275 4737 ntTSL 26.41□□□□□ -1.384e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.494e-6■□□□□ 11.2
SAFBQ15424 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.693e-6■□□□□ 11.1
SAFBQ15424 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 11.1
SAFBQ15424 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.559e-8■□□□□ 11.1
SAFBQ15424 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.453e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.083e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.913e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)26.57■■□□□ 1.843e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 325.23■■□□□ 1.633e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.63e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.563e-6■□□□□ 11
SAFBQ15424 SSUH2-205ENST00000420394 1634 ntTSL 1 (best)23.64■■□□□ 1.383e-6■□□□□ 11
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