Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
TRIM28Q13263 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
TRIM28Q13263 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRIM28Q13263 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TRIM28Q13263 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRIM28Q13263 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
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