Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.9
MAP3K1Q13233 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC39.36■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.32■■■■□ 3.89
MAP3K1Q13233 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAP3K1Q13233 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAP3K1Q13233 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.15■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.14■■■■□ 3.86
MAP3K1Q13233 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC39.13■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC39.09■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
MAP3K1Q13233 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.07■■■■□ 3.84
MAP3K1Q13233 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAP3K1Q13233 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
MAP3K1Q13233 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC39.05■■■■□ 3.84
MAP3K1Q13233 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.05■■■■□ 3.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms