Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 STS1YIR011C 960 nt7.09□□□□□ -1.27
TY2A-OR1Q12439 ERV2YPR037C 591 nt7.09□□□□□ -1.27
TY2A-OR1Q12439 PEX28YHR150W 1740 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 GET2YER083C 858 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 BNS1YGR230W 414 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 NCA3YJL116C 1014 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 RCF2YNR018W 675 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 SPS1YDR523C 1473 nt7.08□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 SLM3YDL033C 1254 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 MET30YIL046W 1923 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.07□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YDR215CYDR215C 414 nt7.06□□□□□ -1.28
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TY2A-OR1Q12439 VPS65YLR322W 315 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YLR358CYLR358C 564 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 CAR2YLR438W 1275 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YPT10YBR264C 600 nt7.06□□□□□ -1.28
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TY2A-OR1Q12439 PPZ2YDR436W 2133 nt7.06□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 EDC2YER035W 438 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YJR142WYJR142W 1029 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 SGF73YGL066W 1974 nt7.05□□□□□ -1.28
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TY2A-OR1Q12439 TOM71YHR117W 1920 nt7.05□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 YNL190WYNL190W 615 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 CRN1YLR429W 1956 nt7.04□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 ARO7YPR060C 771 nt7.03□□□□□ -1.28
TY2A-OR1Q12439 ADE2YOR128C 1716 nt7.03□□□□□ -1.28
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TY2A-OR1Q12439 OPI1YHL020C 1215 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 DSC3YOR223W 879 nt7.02□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 SNA3YJL151C 402 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 SNF7YLR025W 723 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 YOR300WYOR300W 309 nt7.01□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 YGL081WYGL081W 963 nt7□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 YAH1YPL252C 519 nt7□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 YPL264CYPL264C 1062 nt7□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 MSI1YBR195C 1269 nt7□□□□□ -1.29
TY2A-OR1Q12439 SNU71YGR013W 1863 nt6.99□□□□□ -1.29
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TY2A-OR1Q12439 PRY2YKR013W 990 nt6.97□□□□□ -1.29
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TY2A-OR1Q12439 PRE5YMR314W 705 nt6.91□□□□□ -1.3
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TY2A-OR1Q12439 YJL213WYJL213W 996 nt6.89□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 YOR041CYOR041C 432 nt6.89□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 AFG3YER017C 2286 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 MAL31YBR298C 1845 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 PAM17YKR065C 594 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 YML079WYML079W 606 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 YML122CYML122C 381 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 ADH6YMR318C 1083 nt6.88□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 MSS51YLR203C 1311 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 CHA1YCL064C 1083 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 GTS1YGL181W 1191 nt6.87□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 YBL111CYBL111C 2004 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 SPE4YLR146C 903 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt6.86□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 STF1YDL130W-A 261 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 SHO1YER118C 1104 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 CDC16YKL022C 2523 nt6.85□□□□□ -1.31
TY2A-OR1Q12439 HAL5YJL165C 2568 nt6.84□□□□□ -1.31
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