Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TMEM258P61165 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TMEM258P61165 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TMEM258P61165 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 411.7 ms