Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3BP55884 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
EIF3BP55884 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3BP55884 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3BP55884 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms