Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InaP46660 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
InaP46660 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
InaP46660 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InaP46660 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InaP46660 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
InaP46660 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
InaP46660 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
InaP46660 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InaP46660 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InaP46660 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InaP46660 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
InaP46660 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
InaP46660 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
InaP46660 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
InaP46660 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
InaP46660 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
InaP46660 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
InaP46660 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
InaP46660 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
InaP46660 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
InaP46660 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
InaP46660 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
InaP46660 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
InaP46660 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
InaP46660 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
InaP46660 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
InaP46660 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
InaP46660 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
InaP46660 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
InaP46660 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
InaP46660 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
InaP46660 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
InaP46660 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
InaP46660 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
InaP46660 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
InaP46660 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
InaP46660 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InaP46660 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InaP46660 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InaP46660 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InaP46660 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
InaP46660 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
InaP46660 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
InaP46660 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
InaP46660 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
InaP46660 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
InaP46660 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
InaP46660 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms