Protein–RNA interactions for Protein: P41240

CSK, Tyrosine-protein kinase CSK, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSKP41240 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSKP41240 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CSKP41240 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSKP41240 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSKP41240 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSKP41240 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSKP41240 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSKP41240 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CSKP41240 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSKP41240 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSKP41240 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSKP41240 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSKP41240 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSKP41240 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSKP41240 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSKP41240 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CSKP41240 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSKP41240 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSKP41240 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSKP41240 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CSKP41240 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSKP41240 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSKP41240 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSKP41240 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CSKP41240 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSKP41240 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSKP41240 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSKP41240 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSKP41240 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSKP41240 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSKP41240 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSKP41240 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSKP41240 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSKP41240 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSKP41240 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSKP41240 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSKP41240 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSKP41240 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSKP41240 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSKP41240 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSKP41240 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSKP41240 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSKP41240 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSKP41240 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSKP41240 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CSKP41240 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CSKP41240 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSKP41240 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSKP41240 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CSKP41240 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CSKP41240 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSKP41240 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CSKP41240 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSKP41240 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSKP41240 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSKP41240 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSKP41240 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSKP41240 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSKP41240 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSKP41240 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSKP41240 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSKP41240 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSKP41240 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms