Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 LCL3YGL085W 825 nt9.42□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 NBA1YOL070C 1506 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 YJL163CYJL163C 1668 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 FTH1YBR207W 1398 nt9.41□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt9.4□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 CDA1YLR307W 906 nt9.4□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 YPT10YBR264C 600 nt9.4□□□□□ -0.9
YRF1-2P40105 CIA1YDR267C 993 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YNL140CYNL140C 570 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YCL049CYCL049C 939 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 NFS1YCL017C 1494 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 GET2YER083C 858 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YHR033WYHR033W 1272 nt9.39□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 snR4snR4 186 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 COX15YER141W 1461 nt9.38□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 ILV6YCL009C 930 nt9.37□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YLR463CYLR463C 552 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 CRH1YGR189C 1524 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 KTR4YBR199W 1395 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 HOC1YJR075W 1191 nt9.36□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 HTZ1YOL012C 405 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 COQ3YOL096C 939 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 LSC1YOR142W 990 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 TUB1YML085C 1344 nt9.34□□□□□ -0.91
YRF1-2P40105 YDR215CYDR215C 414 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 DAL80YKR034W 810 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 OSW2YLR054C 2175 nt9.33□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 YJL213WYJL213W 996 nt9.32□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 YMR252CYMR252C 405 nt9.32□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 ERR3YMR323W 1314 nt9.32□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 MPE1YKL059C 1326 nt9.31□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 YDL144CYDL144C 1071 nt9.31□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 ASF1YJL115W 840 nt9.31□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 MED6YHR058C 888 nt9.3□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 YOR072WYOR072W 315 nt9.29□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 TFG2YGR005C 1203 nt9.29□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 CCW12YLR110C 402 nt9.29□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 YHL008CYHL008C 1884 nt9.28□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 AGX1YFL030W 1158 nt9.28□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 RPL2AYFR031C-A 765 nt9.28□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 RPL2BYIL018W 765 nt9.28□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 BDS1YOL164W 1941 nt9.28□□□□□ -0.92
YRF1-2P40105 ASR1YPR093C 867 nt9.27□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 ADH5YBR145W 1056 nt9.27□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 PAM17YKR065C 594 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 YBL112CYBL112C 318 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 YPR076WYPR076W 375 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 LEO1YOR123C 1395 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 MET13YGL125W 1803 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 GET4YOR164C 939 nt9.26□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 GPD2YOL059W 1323 nt9.25□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 YOL046CYOL046C 675 nt9.25□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 FIT2YOR382W 462 nt9.25□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 PET10YKR046C 852 nt9.24□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 MRPS18YNL306W 654 nt9.24□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 RCF2YNR018W 675 nt9.24□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 FMP40YPL222W 2067 nt9.22□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 APE4YHR113W 1473 nt9.22□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 PRE3YJL001W 648 nt9.22□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 PPH21YDL134C 1110 nt9.21□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 FPR3YML074C 1236 nt9.21□□□□□ -0.93
YRF1-2P40105 ADE5,7YGL234W 2409 nt9.21□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 ORT1YOR130C 879 nt9.2□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 DMC1YER179W 1005 nt9.2□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 CKB1YGL019W 837 nt9.2□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 CAR2YLR438W 1275 nt9.2□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 CIT2YCR005C 1383 nt9.19□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 YNL092WYNL092W 1203 nt9.17□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 AVL9YLR114C 2295 nt9.17□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 YML018CYML018C 1182 nt9.16□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 YAH1YPL252C 519 nt9.16□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt9.16□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 RTC4YNL254C 1206 nt9.16□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 CDC1YDR182W 1476 nt9.15□□□□□ -0.94
YRF1-2P40105 YIP4YGL198W 708 nt9.14□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 TAF9YMR236W 474 nt9.13□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 RBS1YDL189W 1374 nt9.13□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 PLB2YMR006C 2121 nt9.13□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YPQ2YDR352W 954 nt9.11□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 SUF3tG(CCC)D 72 nt9.11□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YMR295CYMR295C 594 nt9.11□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 PEX28YHR150W 1740 nt9.11□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 PDC5YLR134W 1692 nt9.11□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 DIA4YHR011W 1341 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YMR122CYMR122C 375 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 RRP9YPR137W 1722 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YCR049CYCR049C 447 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YKR045CYKR045C 552 nt9.1□□□□□ -0.95
YRF1-2P40105 YPL102CYPL102C 303 nt9.1□□□□□ -0.95
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