Protein–RNA interactions for Protein: P35398

RORA, Nuclear receptor ROR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORAP35398 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORAP35398 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORAP35398 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORAP35398 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RORAP35398 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RORAP35398 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORAP35398 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RORAP35398 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RORAP35398 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RORAP35398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RORAP35398 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RORAP35398 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RORAP35398 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RORAP35398 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORAP35398 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORAP35398 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RORAP35398 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORAP35398 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORAP35398 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RORAP35398 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RORAP35398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RORAP35398 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORAP35398 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORAP35398 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RORAP35398 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORAP35398 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORAP35398 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RORAP35398 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RORAP35398 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RORAP35398 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RORAP35398 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RORAP35398 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RORAP35398 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RORAP35398 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RORAP35398 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RORAP35398 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORAP35398 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RORAP35398 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RORAP35398 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RORAP35398 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RORAP35398 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RORAP35398 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORAP35398 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORAP35398 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RORAP35398 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORAP35398 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORAP35398 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORAP35398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORAP35398 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RORAP35398 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORAP35398 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORAP35398 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORAP35398 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORAP35398 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RORAP35398 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RORAP35398 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORAP35398 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORAP35398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORAP35398 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RORAP35398 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms