Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB1P08034 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB1P08034 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB1P08034 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB1P08034 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB1P08034 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB1P08034 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB1P08034 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB1P08034 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB1P08034 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB1P08034 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB1P08034 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB1P08034 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB1P08034 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB1P08034 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB1P08034 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB1P08034 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB1P08034 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB1P08034 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB1P08034 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB1P08034 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB1P08034 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB1P08034 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB1P08034 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB1P08034 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB1P08034 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB1P08034 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB1P08034 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB1P08034 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB1P08034 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB1P08034 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB1P08034 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB1P08034 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GJB1P08034 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB1P08034 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
GJB1P08034 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
GJB1P08034 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB1P08034 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB1P08034 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB1P08034 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
GJB1P08034 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB1P08034 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB1P08034 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB1P08034 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GJB1P08034 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
GJB1P08034 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB1P08034 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB1P08034 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB1P08034 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB1P08034 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB1P08034 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB1P08034 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB1P08034 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB1P08034 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB1P08034 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GJB1P08034 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB1P08034 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GJB1P08034 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms