Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.823e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.793e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.483e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.243e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-205ENST00000426344 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 212.77□□□□□ -0.373e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-204ENST00000418653 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.47□□□□□ -0.413e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SNAP47-208ENST00000478768 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.17□□□□□ -0.623e-8■■■■■ 63.9
DKC1O60832 SERPINA6-202ENST00000555056 1609 ntTSL 28.41□□□□□ -1.061e-10■■■■■ 63.8
DKC1O60832 SERPINA6-201ENST00000341584 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-10■■■■■ 63.8
DKC1O60832 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.816e-7■■■■■ 63.7
DKC1O60832 PUM1-208ENST00000471894 812 ntTSL 311.79□□□□□ -0.521e-17■■■■■ 63.6
DKC1O60832 PUM1-210ENST00000490546 707 ntTSL 411.62□□□□□ -0.551e-17■■■■■ 63.6
DKC1O60832 PUM1-223ENST00000532678 793 ntTSL 48.96□□□□□ -0.981e-17■■■■■ 63.6
DKC1O60832 AC005726.2-201ENST00000481916 2091 ntTSL 1 (best)23.18■■□□□ 1.34e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.14e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.234e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 PIGS-201ENST00000268758 2397 ntTSL 213.29□□□□□ -0.284e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 PIGS-206ENST00000487231 3088 ntTSL 1 (best)12.61□□□□□ -0.394e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 PIGS-207ENST00000492429 2658 ntTSL 211.17□□□□□ -0.624e-53■■■■■ 63.3
DKC1O60832 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.49□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 63.1
DKC1O60832 LINC00888-201ENST00000468380 1241 ntTSL 220.77■□□□□ 0.925e-72■■■■■ 63.1
DKC1O60832 LINC00888-202ENST00000471496 1490 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.195e-72■■■■■ 63.1
DKC1O60832 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.3□□□□□ -1.885e-72■■■■■ 63.1
DKC1O60832 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-7■■■■■ 62.8
DKC1O60832 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.544e-7■■■■■ 62.8
DKC1O60832 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 329.05■■■□□ 2.241e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-215ENST00000462807 628 ntTSL 228.88■■■□□ 2.211e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-227ENST00000485083 871 ntTSL 328.1■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 328.1■■■□□ 2.091e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.531e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.431e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-213ENST00000453943 656 ntTSL 1 (best)23.46■■□□□ 1.351e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.145e-17■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-236ENST00000493209 735 ntTSL 521.36■■□□□ 1.011e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.921e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 320.37■□□□□ 0.851e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-214ENST00000460224 639 ntTSL 517.49■□□□□ 0.391e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-238ENST00000498092 865 ntTSL 517.29■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-226ENST00000484953 273 ntTSL 215.73■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-233ENST00000491613 959 ntTSL 315.35■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-211ENST00000412265 1012 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-221ENST00000472939 314 ntTSL 314.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-229ENST00000485733 345 ntTSL 314.43□□□□□ -0.11e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 GUK1-212ENST00000435153 865 ntTSL 313.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 62.8
DKC1O60832 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.273e-10■■■■■ 62.8
DKC1O60832 COG7-202ENST00000561854 814 ntTSL 313.27□□□□□ -0.293e-10■■■■■ 62.8
DKC1O60832 TEAD1-207ENST00000638666 1281 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.455e-17■■■■■ 62.8
DKC1O60832 COG7-204ENST00000566364 939 ntTSL 210.49□□□□□ -0.733e-10■■■■■ 62.8
DKC1O60832 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.245e-17■■■■■ 62.8
DKC1O60832 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.245e-17■■■■■ 62.8
DKC1O60832 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.898e-17■■■■■ 62.5
DKC1O60832 EIPR1-213ENST00000482570 582 ntTSL 213.15□□□□□ -0.32e-8■■■■■ 62.2
DKC1O60832 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.491e-9■■■■■ 62.2
DKC1O60832 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 62.2
DKC1O60832 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.21e-9■■■■■ 62.2
DKC1O60832 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.961e-323■■■■■ 62.2
DKC1O60832 PRRC2A-208ENST00000469577 918 ntTSL 516.39■□□□□ 0.211e-323■■■■■ 62.2
DKC1O60832 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 62.2
DKC1O60832 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.951e-323■■■■■ 62.2
DKC1O60832 ATG16L1-201ENST00000347464 2915 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.271e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-203ENST00000392017 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.511e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-215ENST00000479942 3559 ntTSL 1 (best)10.89□□□□□ -0.671e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-204ENST00000392018 3313 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.761e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-206ENST00000392021 3301 ntTSL 1 (best)10.32□□□□□ -0.761e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-211ENST00000464645 560 ntTSL 410□□□□□ -0.811e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-214ENST00000474148 4208 ntTSL 29.9□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 ATG16L1-218ENST00000498620 740 ntTSL 58.83□□□□□ -11e-323■■■■■ 62.1
DKC1O60832 DKC1-210ENST00000481062 819 ntTSL 214.62□□□□□ -0.075e-42■■■■■ 61.8
DKC1O60832 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.65e-42■■■■■ 61.8
DKC1O60832 RYR2-202ENST00000366574 16562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.576e-7■■■■■ 61.8
DKC1O60832 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.376e-7■■■■■ 61.8
DKC1O60832 DNASE1-213ENST00000576050 965 ntTSL 518.62■□□□□ 0.571e-8■■■■■ 61.7
DKC1O60832 DNASE1-207ENST00000570769 2732 ntTSL 515.27■□□□□ 0.031e-8■■■■■ 61.7
DKC1O60832 DNASE1-202ENST00000407479 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.521e-8■■■■■ 61.7
DKC1O60832 DNASE1-201ENST00000246949 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.743e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-205ENST00000611685 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.99■□□□□ 0.313e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 03e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.34□□□□□ -1.713e-7■■■■■ 61.7
DKC1O60832 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 517.62■□□□□ 0.411e-9■■■■■ 61.6
DKC1O60832 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 224.17■■□□□ 1.462e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.952e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 213.85□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 61.5
DKC1O60832 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-9■■■■■ 61.3
DKC1O60832 ZNF566-207ENST00000472909 587 ntTSL 420.64■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 61.2
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