Protein–RNA interactions for Protein: O43323

DHH, Desert hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHHO43323 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHHO43323 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHHO43323 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHHO43323 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DHHO43323 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHHO43323 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DHHO43323 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHHO43323 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHHO43323 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHHO43323 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHHO43323 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DHHO43323 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHHO43323 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHHO43323 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHHO43323 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DHHO43323 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHHO43323 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHHO43323 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DHHO43323 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DHHO43323 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHHO43323 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHHO43323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHHO43323 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DHHO43323 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DHHO43323 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DHHO43323 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DHHO43323 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DHHO43323 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHHO43323 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHHO43323 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHHO43323 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHHO43323 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHHO43323 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHHO43323 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHHO43323 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHHO43323 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHHO43323 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHHO43323 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHHO43323 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHHO43323 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHHO43323 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHHO43323 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHHO43323 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DHHO43323 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHHO43323 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHHO43323 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DHHO43323 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHHO43323 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHHO43323 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHHO43323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DHHO43323 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DHHO43323 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DHHO43323 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms