Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
MEIS1O00470 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MEIS1O00470 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MEIS1O00470 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEIS1O00470 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms