Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LINC01387J3KSC0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LINC01387J3KSC0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LINC01387J3KSC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LINC01387J3KSC0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms