Protein–RNA interactions for Protein: A8MX34

KRTAP29-1, Keratin-associated protein 29-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP29-1A8MX34 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KRTAP29-1A8MX34 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KRTAP29-1A8MX34 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRTAP29-1A8MX34 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KRTAP29-1A8MX34 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms