Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM72A0PK05 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM72A0PK05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM72A0PK05 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM72A0PK05 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.8 ms