RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606892.1

TRAF3IP2-AS1-211, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 730 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.65■■■□□ 2.82
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CHIC1Q5VXU3 224 aa31.48■■■□□ 2.63
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FOXD1Q16676 465 aa25.88■■□□□ 1.73
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.38■■□□□ 1.65
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.49■■□□□ 1.51
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ADRA2BP18089 450 aa24.45■■□□□ 1.5
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MSH5O43196 834 aa24.15■■□□□ 1.46
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEDQ86YR6 584 aa22.78■■□□□ 1.24
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa22.26■■□□□ 1.15
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.18■■□□□ 1.14
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.79■■□□□ 1.08
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DCAF8L1A6NGE4 600 aa21.21■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 KCNA4P22459 653 aa21.15■□□□□ 0.98
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DNAJC5BQ9UF47 199 aa20.78■□□□□ 0.92
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RNF39Q9H2S5 420 aa20.6■□□□□ 0.89
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SLC4A2P04920 1241 aa20.13■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 APLP2Q06481 763 aa19.71■□□□□ 0.75
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP19.66■□□□□ 0.74
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FOXD4L1Q9NU39 408 aa19.66■□□□□ 0.74
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CAPN15O75808 1086 aa19.64■□□□□ 0.73
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP19.64■□□□□ 0.73
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZBTB22O15209 634 aa19.42■□□□□ 0.7
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 DSG3P32926 999 aa19.42■□□□□ 0.7
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TRHP20396 242 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ABCB7O75027 752 aa19.17■□□□□ 0.66
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ATXN8OSP0DMR3 200 aa19.08■□□□□ 0.64
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.07■□□□□ 0.64
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POLA2Q14181 598 aa19■□□□□ 0.63
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CSRNP3Q8WYN3 585 aa18.93■□□□□ 0.62
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.89■□□□□ 0.61
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.44■□□□□ 0.54
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FBLN2P98095 1184 aa18.42■□□□□ 0.54
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 OSCARQ8IYS5 282 aa18.35■□□□□ 0.53
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 AKT1S1Q96B36 256 aa18.23■□□□□ 0.51
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE2BA6NHP3 402 aa18.15■□□□□ 0.5
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE6P0CI01 402 aa18.15■□□□□ 0.5
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.15■□□□□ 0.5
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP17.98■□□□□ 0.47
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CHRDL2Q6WN34 429 aa17.97■□□□□ 0.47
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 POTEHQ6S545 545 aa17.96■□□□□ 0.47
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SSUH2Q9Y2M2 353 aa17.92■□□□□ 0.46
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PITPNM1O00562 1244 aa17.8■□□□□ 0.44
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP17.7■□□□□ 0.42
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SPDYE4A6NLX3 237 aa17.64■□□□□ 0.41
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CLEC11AQ9Y240 323 aa17.62■□□□□ 0.41
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.61■□□□□ 0.41
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PRR29P0C7W0 189 aa17.43■□□□□ 0.38
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 STAG3Q9UJ98 1225 aa17.39■□□□□ 0.37
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP17.37■□□□□ 0.37
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PROM2Q8N271 834 aa17.28■□□□□ 0.36
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CHADLQ6NUI6 762 aa17.2■□□□□ 0.34
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 HAX1O00165 279 aa17.19■□□□□ 0.34
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FKBP8Q14318 412 aa17.16■□□□□ 0.34
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CREBZFQ9NS37 354 aa17.06■□□□□ 0.32
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 C19orf67A6NJJ6 358 aa17.01■□□□□ 0.31
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 EVX2Q03828 476 aa16.94■□□□□ 0.3
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CD44P16070 742 aaKnown RBP16.84■□□□□ 0.29
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP16.83■□□□□ 0.28
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLEKHG5O94827 1062 aa16.82■□□□□ 0.28
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 MIER1Q8N108 512 aa16.8■□□□□ 0.28
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 FBXO3Q9UK99 471 aa16.78■□□□□ 0.28
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PLCD3Q8N3E9 789 aa16.71■□□□□ 0.27
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZRANB1Q9UGI0 708 aa16.67■□□□□ 0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CLCN6P51797 869 aa16.66■□□□□ 0.26
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 GABBR2O75899 941 aa16.64■□□□□ 0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa16.6■□□□□ 0.25
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 VASPP50552 380 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 PHF12Q96QT6 1004 aa16.43■□□□□ 0.22
TRAF3IP2-AS1-211ENST00000606892 RASEFQ8IZ41 740 aa16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms