RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-211ENST00000555834 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.77■■■□□ 2.04
RPS6KL1-211ENST00000555834 NISCHQ9Y2I1 1504 aa26.91■■□□□ 1.9
RPS6KL1-211ENST00000555834 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
RPS6KL1-211ENST00000555834 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.32■■□□□ 1.8
RPS6KL1-211ENST00000555834 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
RPS6KL1-211ENST00000555834 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.1■■□□□ 1.77
RPS6KL1-211ENST00000555834 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.77■■□□□ 1.72
RPS6KL1-211ENST00000555834 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-211ENST00000555834 APLP2Q06481 763 aa25.47■■□□□ 1.67
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
RPS6KL1-211ENST00000555834 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.34■■□□□ 1.65
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.28■■□□□ 1.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYT1Q01538 1121 aa25.19■■□□□ 1.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
RPS6KL1-211ENST00000555834 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRIM41Q8WV44 630 aa24.8■■□□□ 1.56
RPS6KL1-211ENST00000555834 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
RPS6KL1-211ENST00000555834 NEFLP07196 543 aa24.73■■□□□ 1.55
RPS6KL1-211ENST00000555834 HRCP23327 699 aa24.68■■□□□ 1.54
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
RPS6KL1-211ENST00000555834 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-211ENST00000555834 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
RPS6KL1-211ENST00000555834 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
RPS6KL1-211ENST00000555834 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.07■■□□□ 1.44
RPS6KL1-211ENST00000555834 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.95■■□□□ 1.43
RPS6KL1-211ENST00000555834 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
RPS6KL1-211ENST00000555834 ITGAEP38570 1179 aa23.85■■□□□ 1.41
RPS6KL1-211ENST00000555834 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
RPS6KL1-211ENST00000555834 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
RPS6KL1-211ENST00000555834 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.75■■□□□ 1.39
RPS6KL1-211ENST00000555834 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.7■■□□□ 1.38
RPS6KL1-211ENST00000555834 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
RPS6KL1-211ENST00000555834 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
RPS6KL1-211ENST00000555834 BCANQ96GW7 911 aa23.49■■□□□ 1.35
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
RPS6KL1-211ENST00000555834 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
RPS6KL1-211ENST00000555834 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.18■■□□□ 1.3
RPS6KL1-211ENST00000555834 NEUROD1Q13562 356 aa23.17■■□□□ 1.3
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANP32CO43423 234 aa23.14■■□□□ 1.29
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRIM52Q96A61 297 aa23.01■■□□□ 1.27
RPS6KL1-211ENST00000555834 ABCC9O60706 1549 aa22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1-211ENST00000555834 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-211ENST00000555834 FKBP8Q14318 412 aa22.79■■□□□ 1.24
RPS6KL1-211ENST00000555834 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
RPS6KL1-211ENST00000555834 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
RPS6KL1-211ENST00000555834 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
RPS6KL1-211ENST00000555834 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
RPS6KL1-211ENST00000555834 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.6■■□□□ 1.21
RPS6KL1-211ENST00000555834 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1-211ENST00000555834 BCL11AQ9H165 835 aa22.55■■□□□ 1.2
RPS6KL1-211ENST00000555834 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.19
RPS6KL1-211ENST00000555834 NBR1Q14596 966 aa22.49■■□□□ 1.19
RPS6KL1-211ENST00000555834 P3H3Q8IVL6 736 aa22.47■■□□□ 1.19
RPS6KL1-211ENST00000555834 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RPS6KL1-211ENST00000555834 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 MIER1Q8N108 512 aa22.37■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 ARID3CA6NKF2 412 aa22.36■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 FBLN2P98095 1184 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 TONSLQ96HA7 1378 aa22.34■■□□□ 1.17
RPS6KL1-211ENST00000555834 SCRIBQ14160 1630 aa22.33■■□□□ 1.16
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.31■■□□□ 1.16
RPS6KL1-211ENST00000555834 NEFMP07197 916 aa22.28■■□□□ 1.16
RPS6KL1-211ENST00000555834 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
RPS6KL1-211ENST00000555834 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLC24A1O60721 1099 aa22.25■■□□□ 1.15
RPS6KL1-211ENST00000555834 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
RPS6KL1-211ENST00000555834 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RPS6KL1-211ENST00000555834 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1-211ENST00000555834 ARXQ96QS3 562 aa22.19■■□□□ 1.14
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
RPS6KL1-211ENST00000555834 MRS2Q9HD23 443 aa22.11■■□□□ 1.13
RPS6KL1-211ENST00000555834 TMC1Q8TDI8 760 aa22.1■■□□□ 1.13
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1-211ENST00000555834 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
RPS6KL1-211ENST00000555834 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.93■■□□□ 1.1
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.92■■□□□ 1.1
RPS6KL1-211ENST00000555834 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.91■■□□□ 1.1
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.88■■□□□ 1.09
RPS6KL1-211ENST00000555834 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
RPS6KL1-211ENST00000555834 BECN1Q14457 450 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 CLIP1P30622 1438 aa21.82■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa21.78■■□□□ 1.08
RPS6KL1-211ENST00000555834 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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