RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517475.1

RDH10-AS1-202, RDH10 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene RDH10-AS1, Length 470 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH10-AS1-202ENST00000517475 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEDQ86YR6 584 aa13.53□□□□□ -0.24
RDH10-AS1-202ENST00000517475 MSH5O43196 834 aa12.89□□□□□ -0.35
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEHQ6S545 545 aa10.48□□□□□ -0.73
RDH10-AS1-202ENST00000517475 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.21□□□□□ -0.77
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 AKT1S1Q96B36 256 aa9.29□□□□□ -0.92
RDH10-AS1-202ENST00000517475 HAX1O00165 279 aa9.23□□□□□ -0.93
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 SPDYE6P0CI01 402 aa8.77□□□□□ -1.01
RDH10-AS1-202ENST00000517475 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.77□□□□□ -1.01
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEIP0CG38 1075 aa8.74□□□□□ -1.01
RDH10-AS1-202ENST00000517475 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RDH10-AS1-202ENST00000517475 CLEC11AQ9Y240 323 aa8.72□□□□□ -1.01
RDH10-AS1-202ENST00000517475 CHADLQ6NUI6 762 aa8.66□□□□□ -1.02
RDH10-AS1-202ENST00000517475 SSUH2Q9Y2M2 353 aa8.63□□□□□ -1.03
RDH10-AS1-202ENST00000517475 FBLN2P98095 1184 aa8.6□□□□□ -1.03
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 ATXN8OSP0DMR3 200 aa8.54□□□□□ -1.04
RDH10-AS1-202ENST00000517475 CD44P16070 742 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RDH10-AS1-202ENST00000517475 CLCN6P51797 869 aa8.54□□□□□ -1.04
RDH10-AS1-202ENST00000517475 PRR29P0C7W0 189 aa8.51□□□□□ -1.05
RDH10-AS1-202ENST00000517475 OTUD5Q96G74 571 aa8.5□□□□□ -1.05
RDH10-AS1-202ENST00000517475 ZBTB22O15209 634 aa8.49□□□□□ -1.05
RDH10-AS1-202ENST00000517475 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.47□□□□□ -1.05
RDH10-AS1-202ENST00000517475 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEMA6NI47 508 aa8.46□□□□□ -1.06
RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEB2H3BUK9 544 aa8.44□□□□□ -1.06
RDH10-AS1-202ENST00000517475 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEGQ6S5H5 508 aa8.41□□□□□ -1.06
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RDH10-AS1-202ENST00000517475 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.35□□□□□ -1.07
RDH10-AS1-202ENST00000517475 ZRANB1Q9UGI0 708 aa8.33□□□□□ -1.08
RDH10-AS1-202ENST00000517475 ABCC9O60706 1549 aa8.29□□□□□ -1.08
RDH10-AS1-202ENST00000517475 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RDH10-AS1-202ENST00000517475 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.27□□□□□ -1.09
RDH10-AS1-202ENST00000517475 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
RDH10-AS1-202ENST00000517475 POTEJP0CG39 1038 aa8.24□□□□□ -1.09
RDH10-AS1-202ENST00000517475 CREBZFQ9NS37 354 aa8.24□□□□□ -1.09
RDH10-AS1-202ENST00000517475 PHF12Q96QT6 1004 aa8.19□□□□□ -1.1
RDH10-AS1-202ENST00000517475 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.16□□□□□ -1.1
RDH10-AS1-202ENST00000517475 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
RDH10-AS1-202ENST00000517475 EHMT2Q96KQ7 1210 aa8.15□□□□□ -1.1
RDH10-AS1-202ENST00000517475 METRNQ9UJH8 293 aa8.15□□□□□ -1.1
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