RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214564.1

Cbx3-ps8-201, mousemouse

BASIC

Gene Cbx3-ps8, Length 548 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa26.98■■□□□ 1.91
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 NischQ80TM9 1593 aa26.45■■□□□ 1.82
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Abcc9P70170 1546 aa26.08■■□□□ 1.77
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Abcc8B2RUS7 1588 aa25.79■■□□□ 1.72
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 ScribQ80U72 1612 aa25.25■■□□□ 1.63
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 NacadQ5SWP3 1504 aa24.4■■□□□ 1.5
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.32■■□□□ 1.48
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Kdm5dQ62240 1548 aa24.28■■□□□ 1.48
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Sycp2Q9CUU3 1500 aa23.96■■□□□ 1.43
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 BicraF8VPZ9 1578 aa23.74■■□□□ 1.39
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Dcaf1Q80TR8 1506 aa23.54■■□□□ 1.36
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa22.95■■□□□ 1.26
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa22.87■■□□□ 1.25
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ercc6F8VPZ5 1481 aa22.7■■□□□ 1.22
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Dnajc5P60904 198 aa22.68■■□□□ 1.22
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Crybg2B7ZCC2 1516 aa22.62■■□□□ 1.21
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Fam135aQ6NS59 1506 aa22.6■■□□□ 1.21
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Baz1aO88379 1555 aa22.59■■□□□ 1.21
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Smarca2Q6DIC0 1577 aa22.5■■□□□ 1.19
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa22.34■■□□□ 1.17
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ccdc180J3QNE4 1664 aa22.33■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Frmpd1A2AKB4 1549 aa22.3■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Baz1bQ9Z277 1479 aa22.29■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Trim41Q5NCC3 630 aa22.29■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rhox8Q6VSS7 320 aa22.29■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Wdr62Q3U3T8 1523 aa22.28■■□□□ 1.16
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.26■■□□□ 1.15
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa22.19■■□□□ 1.14
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Mrc2Q64449 1479 aa22.1■■□□□ 1.13
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Unc13aQ4KUS2 1712 aa21.8■■□□□ 1.08
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa21.6■■□□□ 1.05
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 CftrP26361 1476 aa21.52■■□□□ 1.04
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Shroom2A2ALU4 1481 aa21.51■■□□□ 1.03
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cux2P70298 1426 aa21.45■■□□□ 1.02
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa21.4■■□□□ 1.02
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Col17a1Q07563 1470 aa21.39■■□□□ 1.01
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Synj1Q8CHC4 1574 aa21.36■■□□□ 1.01
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Kif21aQ9QXL2 1672 aa21.32■■□□□ 1
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Kif15Q6P9L6 1387 aa21.31■■□□□ 1
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
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Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cep164Q5DU05 1446 aa21.03■□□□□ 0.96
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Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Lamc3Q9R0B6 1581 aa20.99■□□□□ 0.95
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa20.93■□□□□ 0.94
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.94
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Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rusc2Q80U22 1514 aa20.78■□□□□ 0.92
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Chic1Q8CBW7 227 aa20.76■□□□□ 0.91
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ift140E9PY46 1464 aa20.74■□□□□ 0.91
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Crocc2F6XLV1 1638 aa20.73■□□□□ 0.91
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ccdc18Q640L5 1455 aa20.73■□□□□ 0.91
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rtl1Q7M732 1744 aa20.69■□□□□ 0.9
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Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.63■□□□□ 0.89
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Gm156Q58A37 223 aa20.55■□□□□ 0.88
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Camsap1A2AHC3 1581 aa20.54■□□□□ 0.88
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Mapk8ip2Q9ERE9 830 aa20.53■□□□□ 0.88
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Disp1Q3TDN0 1521 aa20.53■□□□□ 0.88
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 PtprkP35822 1457 aa20.52■□□□□ 0.88
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 TnnQ80Z71 1560 aa20.51■□□□□ 0.87
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 PtprtQ99M80 1454 aa20.49■□□□□ 0.87
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Duox2A2AQ99 1517 aa20.47■□□□□ 0.87
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa20.44■□□□□ 0.86
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cep170Q6A065 1588 aa20.43■□□□□ 0.86
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.43■□□□□ 0.86
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Golga3P55937 1487 aa20.42■□□□□ 0.86
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Fgd6Q69ZL1 1399 aa20.37■□□□□ 0.85
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Setd1bQ8CFT2 1985 aa20.26■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Cngb1E1AZ71 1325 aa20.26■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Samd9lQ69Z37 1561 aa20.25■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Grin2bQ01097 1482 aa20.24■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Pprc1Q6NZN1 1644 aa20.23■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 AknaQ80VW7 1404 aa20.2■□□□□ 0.82
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rad54l2Q99NG0 1466 aa20.2■□□□□ 0.82
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa20.18■□□□□ 0.82
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Abcc1O35379 1528 aa20.17■□□□□ 0.82
Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa20.17■□□□□ 0.82
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