RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000178377.1

Rab11b-ps2-201, mousemouse

BASIC

Gene Rab11b-ps2, Length 657 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa30■■■□□ 2.39
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 NischQ80TM9 1593 aa29.39■■■□□ 2.29
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Abcc8B2RUS7 1588 aa28.52■■■□□ 2.16
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Abcc9P70170 1546 aa28.49■■■□□ 2.15
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 ScribQ80U72 1612 aa27.71■■■□□ 2.03
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Kdm5dQ62240 1548 aa26.64■■□□□ 1.85
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 NacadQ5SWP3 1504 aa26.61■■□□□ 1.85
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Dcaf1Q80TR8 1506 aa26.2■■□□□ 1.79
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Sycp2Q9CUU3 1500 aa26.16■■□□□ 1.78
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 BicraF8VPZ9 1578 aa25.93■■□□□ 1.74
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa25.61■■□□□ 1.69
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa25.37■■□□□ 1.65
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ccdc180J3QNE4 1664 aa25.26■■□□□ 1.63
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Baz1aO88379 1555 aa25.22■■□□□ 1.63
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Crybg2B7ZCC2 1516 aa25.13■■□□□ 1.61
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rhox8Q6VSS7 320 aa24.95■■□□□ 1.58
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa24.57■■□□□ 1.52
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Smarca2Q6DIC0 1577 aa24.55■■□□□ 1.52
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa24.52■■□□□ 1.52
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa24.47■■□□□ 1.51
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ercc6F8VPZ5 1481 aa24.44■■□□□ 1.5
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Fam135aQ6NS59 1506 aa24.4■■□□□ 1.5
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Wdr62Q3U3T8 1523 aa24.31■■□□□ 1.48
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Frmpd1A2AKB4 1549 aa24.27■■□□□ 1.48
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Unc13aQ4KUS2 1712 aa24.1■■□□□ 1.45
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rtl1Q7M732 1744 aa23.97■■□□□ 1.43
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.96■■□□□ 1.43
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 CftrP26361 1476 aa23.88■■□□□ 1.41
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa23.87■■□□□ 1.41
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Synj1Q8CHC4 1574 aa23.86■■□□□ 1.41
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.75■■□□□ 1.39
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Mrc2Q64449 1479 aa23.73■■□□□ 1.39
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa23.46■■□□□ 1.35
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa23.33■■□□□ 1.33
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cux2P70298 1426 aa23.27■■□□□ 1.32
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Kif21aQ9QXL2 1672 aa23.26■■□□□ 1.31
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Lamc3Q9R0B6 1581 aa23.23■■□□□ 1.31
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Kif15Q6P9L6 1387 aa23.22■■□□□ 1.31
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Trim41Q5NCC3 630 aa23.01■■□□□ 1.27
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 TnnQ80Z71 1560 aa23■■□□□ 1.27
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Top2bQ64511 1612 aa22.97■■□□□ 1.27
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Dnajc5P60904 198 aa22.96■■□□□ 1.27
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cep164Q5DU05 1446 aa22.85■■□□□ 1.25
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Golga3P55937 1487 aa22.83■■□□□ 1.25
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Camsap1A2AHC3 1581 aa22.8■■□□□ 1.24
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Plb1Q3TTY0 1478 aa22.77■■□□□ 1.24
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.73■■□□□ 1.23
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ccdc18Q640L5 1455 aa22.71■■□□□ 1.23
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Crocc2F6XLV1 1638 aa22.71■■□□□ 1.23
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Il27Q8K3I6 234 aa22.61■■□□□ 1.21
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Fmn1Q05860 1466 aa22.6■■□□□ 1.21
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cngb1E1AZ71 1325 aa22.55■■□□□ 1.2
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rusc2Q80U22 1514 aa22.54■■□□□ 1.2
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Setd1bQ8CFT2 1985 aa22.52■■□□□ 1.2
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ift140E9PY46 1464 aa22.51■■□□□ 1.19
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Duox2A2AQ99 1517 aa22.48■■□□□ 1.19
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Col17a1Q07563 1470 aa22.46■■□□□ 1.19
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Grin2bQ01097 1482 aa22.44■■□□□ 1.18
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Disp1Q3TDN0 1521 aa22.41■■□□□ 1.18
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Samd9lQ69Z37 1561 aa22.41■■□□□ 1.18
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa22.26■■□□□ 1.15
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Efcab5A0JP43 1406 aa22.23■■□□□ 1.15
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa22.19■■□□□ 1.14
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Magi3Q9EQJ9 1476 aa22.19■■□□□ 1.14
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Rad54l2Q99NG0 1466 aa22.18■■□□□ 1.14
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Grin2aP35436 1464 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 NrkQ9R0G8 1455 aa22.13■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Gpatch8A2A6A1 1505 aa22.12■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 PtprkP35822 1457 aa22.09■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Shroom4Q1W617 1475 aa22.03■■□□□ 1.12
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Pla2r1Q62028 1487 aa22.03■■□□□ 1.12
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Chic1Q8CBW7 227 aa22.01■■□□□ 1.11
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 SynmQ70IV5 1561 aa21.98■■□□□ 1.11
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.96■■□□□ 1.11
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Cep170Q6A065 1588 aa21.93■■□□□ 1.1
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.9■■□□□ 1.1
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.88■■□□□ 1.09
Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 Chd1P40201 1711 aa21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.6 ms