RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000174654.1

Gm20470-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm20470, Length 331 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.71■■■□□ 2.19
Gm20470-201ENSMUST00000174654 NischQ80TM9 1593 aa28.15■■■□□ 2.1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.31■■□□□ 1.96
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Abcc9P70170 1546 aa27.29■■□□□ 1.96
Gm20470-201ENSMUST00000174654 ScribQ80U72 1612 aa26.39■■□□□ 1.81
Gm20470-201ENSMUST00000174654 NacadQ5SWP3 1504 aa25.57■■□□□ 1.68
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Kdm5dQ62240 1548 aa25.47■■□□□ 1.67
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Dcaf1Q80TR8 1506 aa25.22■■□□□ 1.63
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.07■■□□□ 1.6
Gm20470-201ENSMUST00000174654 BicraF8VPZ9 1578 aa24.72■■□□□ 1.55
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.5■■□□□ 1.51
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ccdc180J3QNE4 1664 aa24.29■■□□□ 1.48
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.27■■□□□ 1.48
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Baz1aO88379 1555 aa24.2■■□□□ 1.46
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.08■■□□□ 1.45
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.9■■□□□ 1.42
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.52■■□□□ 1.36
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.49■■□□□ 1.35
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.45■■□□□ 1.34
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.43■■□□□ 1.34
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.39■■□□□ 1.34
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.37■■□□□ 1.33
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.31■■□□□ 1.32
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.28■■□□□ 1.32
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.22■■□□□ 1.31
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
Gm20470-201ENSMUST00000174654 CftrP26361 1476 aa22.91■■□□□ 1.26
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rtl1Q7M732 1744 aa22.89■■□□□ 1.26
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.86■■□□□ 1.25
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.84■■□□□ 1.25
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ubl4bQ9CQ84 188 aa22.79■■□□□ 1.24
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Mrc2Q64449 1479 aa22.78■■□□□ 1.24
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.76■■□□□ 1.23
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.41■■□□□ 1.18
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cux2P70298 1426 aa22.31■■□□□ 1.16
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.28■■□□□ 1.16
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.27■■□□□ 1.16
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.24■■□□□ 1.15
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Trim41Q5NCC3 630 aa22.22■■□□□ 1.15
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.14■■□□□ 1.14
Gm20470-201ENSMUST00000174654 TnnQ80Z71 1560 aa22.01■■□□□ 1.11
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cep164Q5DU05 1446 aa22■■□□□ 1.11
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Dnajc5P60904 198 aa22■■□□□ 1.11
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Top2bQ64511 1612 aa21.95■■□□□ 1.1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Golga3P55937 1487 aa21.92■■□□□ 1.1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.9■■□□□ 1.1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Shroom2A2ALU4 1481 aa21.86■■□□□ 1.09
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
Gm20470-201ENSMUST00000174654 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.82■■□□□ 1.08
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.78■■□□□ 1.08
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.74■■□□□ 1.07
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Fmn1Q05860 1466 aa21.73■■□□□ 1.07
Gm20470-201ENSMUST00000174654 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ift140E9PY46 1464 aa21.66■■□□□ 1.06
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rusc2Q80U22 1514 aa21.6■■□□□ 1.05
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Il27Q8K3I6 234 aa21.6■■□□□ 1.05
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.57■■□□□ 1.04
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Duox2A2AQ99 1517 aa21.56■■□□□ 1.04
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Grin2bQ01097 1482 aa21.53■■□□□ 1.04
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Col17a1Q07563 1470 aa21.51■■□□□ 1.03
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.47■■□□□ 1.03
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Efcab5A0JP43 1406 aa21.46■■□□□ 1.03
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.39■■□□□ 1.02
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.39■■□□□ 1.01
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
Gm20470-201ENSMUST00000174654 NrkQ9R0G8 1455 aa21.3■■□□□ 1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Setd1bQ8CFT2 1985 aa21.3■■□□□ 1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Gpatch8A2A6A1 1505 aa21.27■■□□□ 1
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.23■□□□□ 0.99
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Grin2aP35436 1464 aa21.22■□□□□ 0.99
Gm20470-201ENSMUST00000174654 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.16■□□□□ 0.98
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.14■□□□□ 0.98
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Shroom4Q1W617 1475 aa21.13■□□□□ 0.97
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Pla2r1Q62028 1487 aa21.07■□□□□ 0.96
Gm20470-201ENSMUST00000174654 SynmQ70IV5 1561 aa21.07■□□□□ 0.96
Gm20470-201ENSMUST00000174654 PtprkP35822 1457 aa21.07■□□□□ 0.96
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Adgrl3Q80TS3 1537 aa20.99■□□□□ 0.95
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa20.98■□□□□ 0.95
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Cep170Q6A065 1588 aa20.97■□□□□ 0.95
Gm20470-201ENSMUST00000174654 Chic1Q8CBW7 227 aa20.97■□□□□ 0.95
Gm20470-201ENSMUST00000174654 CadpsQ80TJ1 1355 aa20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 181.8 ms