RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000159039.1

Cmtm1-201, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cmtm1, Length 1,130 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa28.44■■■□□ 2.14
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 NischQ80TM9 1593 aa27.99■■■□□ 2.07
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Abcc8B2RUS7 1588 aa27.21■■□□□ 1.95
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Abcc9P70170 1546 aa27.05■■□□□ 1.92
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 ScribQ80U72 1612 aa26.34■■□□□ 1.81
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 NacadQ5SWP3 1504 aa25.58■■□□□ 1.69
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Kdm5dQ62240 1548 aa25.43■■□□□ 1.66
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Sycp2Q9CUU3 1500 aa25.1■■□□□ 1.61
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Dcaf1Q80TR8 1506 aa24.97■■□□□ 1.59
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 BicraF8VPZ9 1578 aa24.76■■□□□ 1.55
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa24.69■■□□□ 1.54
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa24.3■■□□□ 1.48
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Crybg2B7ZCC2 1516 aa24.09■■□□□ 1.45
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Baz1aO88379 1555 aa23.99■■□□□ 1.43
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ccdc180J3QNE4 1664 aa23.86■■□□□ 1.41
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rhox8Q6VSS7 320 aa23.85■■□□□ 1.41
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa23.62■■□□□ 1.37
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ercc6F8VPZ5 1481 aa23.62■■□□□ 1.37
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Smarca2Q6DIC0 1577 aa23.54■■□□□ 1.36
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Fam135aQ6NS59 1506 aa23.46■■□□□ 1.35
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa23.4■■□□□ 1.34
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa23.37■■□□□ 1.33
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Baz1bQ9Z277 1479 aa23.31■■□□□ 1.32
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Frmpd1A2AKB4 1549 aa23.3■■□□□ 1.32
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Wdr62Q3U3T8 1523 aa23.29■■□□□ 1.32
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ubl4bQ9CQ84 188 aa23.12■■□□□ 1.29
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Mrc2Q64449 1479 aa22.93■■□□□ 1.26
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 CftrP26361 1476 aa22.8■■□□□ 1.24
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Dnajc5P60904 198 aa22.74■■□□□ 1.23
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Unc13aQ4KUS2 1712 aa22.71■■□□□ 1.23
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa22.65■■□□□ 1.22
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Synj1Q8CHC4 1574 aa22.62■■□□□ 1.21
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Trim41Q5NCC3 630 aa22.51■■□□□ 1.19
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cux2P70298 1426 aa22.43■■□□□ 1.18
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa22.41■■□□□ 1.18
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Kif15Q6P9L6 1387 aa22.36■■□□□ 1.17
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa22.33■■□□□ 1.16
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rtl1Q7M732 1744 aa22.29■■□□□ 1.16
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Kif21aQ9QXL2 1672 aa22.17■■□□□ 1.14
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Lamc3Q9R0B6 1581 aa22.16■■□□□ 1.14
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Shroom2A2ALU4 1481 aa22.11■■□□□ 1.13
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cep164Q5DU05 1446 aa22.08■■□□□ 1.13
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Plb1Q3TTY0 1478 aa21.92■■□□□ 1.1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ccdc18Q640L5 1455 aa21.87■■□□□ 1.09
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Col17a1Q07563 1470 aa21.86■■□□□ 1.09
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Pabpn1Q8CCS6 302 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Il27Q8K3I6 234 aa21.82■■□□□ 1.08
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 TnnQ80Z71 1560 aa21.78■■□□□ 1.08
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ift140E9PY46 1464 aa21.71■■□□□ 1.07
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Golga3P55937 1487 aa21.71■■□□□ 1.07
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Crocc2F6XLV1 1638 aa21.7■■□□□ 1.06
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Camsap1A2AHC3 1581 aa21.69■■□□□ 1.06
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Top2bQ64511 1612 aa21.68■■□□□ 1.06
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rusc2Q80U22 1514 aa21.64■■□□□ 1.05
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cngb1E1AZ71 1325 aa21.56■■□□□ 1.04
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Duox2A2AQ99 1517 aa21.55■■□□□ 1.04
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Fmn1Q05860 1466 aa21.52■■□□□ 1.04
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Zcchc11B2RX14 1644 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Disp1Q3TDN0 1521 aa21.52■■□□□ 1.04
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cc2d2bA0A286YDU8 1405 aa21.45■■□□□ 1.02
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Nup160Q9Z0W3 1402 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Grin2bQ01097 1482 aa21.43■■□□□ 1.02
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Efcab5A0JP43 1406 aa21.39■■□□□ 1.02
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Samd9lQ69Z37 1561 aa21.28■■□□□ 1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Fgd6Q69ZL1 1399 aa21.28■■□□□ 1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Adgrl3Q80TS3 1537 aa21.25■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 PtprkP35822 1457 aa21.23■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Gm156Q58A37 223 aa21.22■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Rad54l2Q99NG0 1466 aa21.21■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa21.21■□□□□ 0.99
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Grin2aP35436 1464 aa21.2■□□□□ 0.98
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Magi3Q9EQJ9 1476 aa21.18■□□□□ 0.98
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Arhgef5E9Q7D5 1581 aa21.16■□□□□ 0.98
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa21.16■□□□□ 0.98
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 NrkQ9R0G8 1455 aa21.14■□□□□ 0.98
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Cep170Q6A065 1588 aa21.12■□□□□ 0.97
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Setd1bQ8CFT2 1985 aa21.1■□□□□ 0.97
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 PtprtQ99M80 1454 aa21.1■□□□□ 0.97
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ttbk1Q6PCN3 1308 aa21.09■□□□□ 0.97
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 CadpsQ80TJ1 1355 aa21.05■□□□□ 0.96
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP21.02■□□□□ 0.96
Cmtm1-201ENSMUST00000159039 AknaQ80VW7 1404 aa21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.2 ms